Fork me on GitHub

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这两天服务器出现了问题，提交的任务总是跑一两天就，节点就挂了，后续的工作也进行不下去，划了两天水，一气之下，决定往电脑上安装一个Ubuntu，看能不能在电脑上跑一些任务，这里记载一下学习的流程。 下载与安装Ubuntu 18.04.4 LTS 下载一个最新版本的文件，文件结尾为.ISO 1 创建一个启动U盘1.1 备份U盘里的数据,U盘要大于4GB1.2 下载Rufus,按照说明运行即可 2 安装这里因为BIOS卡了很长时间，最后的解决方式如下，注，我的电脑是惠普2.1 之前插入的U盘不用拔下来，直接重启电脑2.2 在电脑刚出现启动图标时，不停地按住F10，会进入bios，用上下左右键 ...
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连锁不平衡（linkage disequilibrium,LD）是指在某一个群体中，不同座位上两个基因同时遗传的频率明显高于预期的随机频率现象。一般用D，D’ 和 r^2^来表示LD的程度。 D 是LD的基本单位，度量观察到的单倍型频率与平衡状态下期望频率的偏差，算法如下： D=P(AB)-P(A)*P(B);其中：P(AB)表示实际观察到的AB频率，P(A)*P(B)表示AB频率的期望值。（如果发生连锁不平衡，实际观测到的AB频率肯定不等于AB频率的期望值）如果D值显著偏离0，则说明存在LD。因为D的取值强烈地依赖于人为制定的等位基因频率，所以它不利于LD程度的比较。 标准化的不 ...
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Jimmy的梦2019.05.25Jimmy：我做了一个特别伤心的梦，醒了以后好久才缓过来我梦见你要座飞机回中国了，然后我就哭了，我的妹妹想去飞机场找你告诉你，因为你要走，Jimmy 伤心的都哭了，他不想让你走。因为她英语也不好，所以她问我哭用英语怎么说，我告诉她哭用英语是cry, 我还叮嘱她，你见到Ariel跟她说话的时候，一定要用短的，很简单的句子，不然她可能听不懂。而且记得不能用复杂的词，比如说，飞机你要说airplane 不能说aircraft,这样她会听不懂的….她会问你，什么是aircraft呢？天呀，多可怜又可爱的梦呀! 在梦里都在担心我的英语\泪奔我问jimmy，what is ...
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时间过得超级快，转眼间，我在慕尼黑已经呆了四个月了。现在我要做的是对我这两个月做个总结，以及对我的后两个月列出一份可行的计划。慕尼黑的冬季，温度波动在-3℃-1℃，气温很温和，加上隔几天就会飞起大大的雪花，我非常喜欢。在这两个月里，因为中间穿插着冬至、圣诞、元旦，所以我明显变得懒散了许多。因为假期后遗症，（尽管我的假期都被我拿来睡觉了），尽管刚喝了很浓的咖啡，我还是免不了一看电脑就想睡觉。图书馆更是一个多月都没有去了。以前定的计划几乎都没有实现，但还是有一些进展： 回顾工作 见到了Pete，第一次见到了我的样本！然后顺利地联系到了公司，成功送样。这大概是令我最开心的事情了，我希望在2月 ...
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在床上躺了有一个多星期了。眼看着从22日变成了31日，心里焦灼着有很多事情没有做，但却提不起精神来，干脆就这样睡过去吧！好像，那个即将要来的2019还很遥远很遥远一样。 偶然间听到了谢安琪的‘年度之歌’。再次听到这首去年已经被我听到滚瓜烂熟的歌时，还是会觉得眼泪想要流出来。与这首歌一起浮现在脑海中的，还有那时的自己。我突然觉得，应该爬起来对这一年做个总结了，因为好好告别以后，才能更义无反顾地向前走啊！ 再见，2018“越美好，越害怕得到”被失眠折磨了好几个月。1月13日和1月20日，考完了人生中最痛苦的两次考试——托福与GRE。康奈尔、德州理工、西吉福尼亚大学、马尔堡大学的失败，是注定要来 ...
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5月底，可能被压抑的悲伤和情绪，使我有了疯狂想要逃离到一个地方的念头。所以从决定到出发，几乎就一瞬间，我买好了去福建的机票。时隔三年，我又一次回到母校，见到了好久不见的朋友，也让我明白，即使隔着千里的距离，我从来都没有失去过，那些肩膀。 见到小云的时候，她在安安静静，有条不紊地整理教材。每天一个人上班，一个人下班，回到家里一个人做饭，背会单词，看会电视剧或小说，然后睡觉，这就是小云的生活，简简单单，平平淡淡。不孤独，不忧伤，没有大喜大悲，也不会过度紧张，过度安逸。小云的生活像极了她的性格。但跟她在一起，却有无比踏实和安心的感觉。希望下次再见面，小云还是这样岁月静好的模样。 小珍还是一样 ...
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Access and overview of HPC(High Performance Systems)http://doku.lrz.de HPC opend for ignightmpp2 mpp3 ivymuc inter System Name Cores per node RAM per node(GB) MaxJobLimitsNodes MaxJobLimitsCores AllTime Queue Login Node Linux Cluster CoolMUC-2 28 64 60 1680 48h mpp2 lxlogin5.lrz.de, lxlogi ...
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这篇文章在2018年12月3日发表在Nature Ecology&Evolution上原文链接：https://www.nature.com/articles/s41559-018-0719-8#Sec13 研究对象：AureliaAurelia海月水母属于刺细胞动物门（Cnidaria），水母亚门（Medusozoa）。水母亚门又可以再分为水螅纲（Hydrozoa，代表动物水螅Hydra）和钵水母纲（Scyphozoa，本文中的主角）。同属于这个门的还有珊瑚纲（Anthozoa，海葵Actiniaria、珊瑚）。到此文中涉及到的主要的动物都已经闪亮登场。 为什么要研究它呢？1. ...
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sizecutter.py统计N50,scaffold长度等信息 FALCONexperimental PacBio diploid assembler quast.py比较不同的assembly的质量，也可以统计assembly的信息http://quast.bioinf.spbau.ru/manual.html 123456789101112131415161718192021source activate /naslx/projects/pn69xe/di52zuy/ignite_tools_py3/quast.py ...
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